El Consejo Superior de Estadística puede actuar en Pleno o en Comisión Permanente.
La Comisión Permanente, presidida por la Presidenta del Instituto Nacional de Estadística, cuenta con doce consejeros, mitad de la Administración General del Estado y mitad de instituciones sociales, económicas y académicas.
Se reúne normalmente tres veces al año para dictaminar las operaciones estadísticas para fines estatales y, por razones de urgencia, los programas anuales de desarrollo del PEN.